一个被丢弃在路边的人脑，偶然的被生命科学家比留间博士所捡获，他利用14年前死了的女友身体，让她起死回生为人造少女“仁奈”，可是那人脑的主体却属于另一位少年……少年的脑，能重返他原来的身体吗？答案是，少年的脑与“仁奈”日益同化，更在与人造人对抗时，发现了那“造物主”的真正目的，以及自己的命运！最后，科学家带着造物主及他的实验室一起进入了另一空间，主角最后踏上了寻找科学家的路......