御厨惠，一名个头小、皮肤白皙、身材瘦弱的中学二年级学生。脸蛋像母亲，五官算得上端正，不过无论是读书或运动，都不十分在行。没想到在他这样平凡的人身上，也会出现不可思议的大变化──这……完全得归功於从事鍊金术师职业的父亲为他制造了一个人造妖精亚奈……除了亚奈的加入之外，他还必须与来到魔女母亲身边修行的上级魔女艾莉卡同住一个屋檐下。而这一连串不可思议的大变化，竟然是世界动摇的前兆──1910年，哈雷彗星的『来访』为世界揭开了魔法的序幕，在100年後的今天，世界将再度暴露在崭新的激烈变化中……