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故事主角进藤光一开始是个小学生,在去爷爷家玩耍的时候他发现了一块有着血迹的棋盘,奇怪的是别人竟然都看不见那快血迹,就在他惊讶的时候他的面前出现了一个温文而雅的自称叫做藤原佐为的鬼魂。原来在平安时代,佐为是当时的围棋国手天天陪着主公下棋,但是在一次围棋比赛中他被歼人陷害不仅失去了比赛胜利而且还被名誉诬陷赶出了京城,心灰意懒又无求生本领的佐为气愤之下投合自尽,但是由于他实在太想成为天下第一……

以棋魂的人气配角小亮为视野的漫画,讲述完结之后主要配角们的故事

棋魂的故事原作者崛田由美来告诉你漫画真正的乐趣

有一天,小学六年级的进藤光在爷爷家的仓库里,找到一个古老的棋盘。 而隐藏在其中的血痕竟然只有他看得见。 就在阿光碰到棋盘的瞬间,寄宿在棋盘上的平安时代的天才棋士——藤原佐为的灵魂潜入阿光的意识里。 原来那个棋盘是平安时代的棋士。 藤原佐为灵魂所暂居的地方,而佐为为了追求“神之一招”的围棋技艺,魂魄始终不肯离开棋盘,为的是寻找能与他共鸣的人。 转自 轻之国度

ジャンプ・スーパーアニメツアー2002(2001年秋冬)で上映。スタッフなどはテレビアニメ版と同一。その後、2002年の『週刊少年ジャンプ』8号から10号にて読者全員プレゼント企画でビデオが頒布された。また、2009年11月発売のDVD-BOX「『ヒカルの碁』全集」にて初DVD化されている。本作のみ手書きのセル画によるアニメになっておりデジタル制作されたテレビアニメ版とは雰囲気が異なる。